Multi-omics “Upstream Analysis” of regulatory genomic regions helps identifying targets against methotrexate resistance of colon cancer
Beitrag, Englisch, ELSEVIER Ltd.
Autoren: Dr. Alexander Kel, Philip Stegmaier, Jeannette Koschman und 2 weitere
Herausgeber / Co-Autor: Alexander E. Kel, Philip Stegmaier, Tagir Valeev, Jeannette Koschmann, Vladimir Poroikov, Olga V. Kel-Margoulis, Edgar Wingender
Erscheinungsdatum: 15.02.2017
Quelle: EuPA Open Proteomics 12, 1-13
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Highlights
- Upstream analysis strategy for multi-omics data is proposed.
- Drug targets are predicted by search for TFBS and analysis of signaling network.
- Methotrexate resistance data include transcriptomics, proteomics and epigenomics.
- Predicted targets are: TGFalpha, IGFBP7, alpha9-integrin.
- Predicted drugs are: zardaverine, divalproex and human metabolite nicotinamide N-oxide.
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