Multi-omics “Upstream Analysis” of regulatory genomic regions helps identifying targets against methotrexate resistance of colon cancer
Multi-omics “Upstream Analysis” of regulatory genomic regions helps identifying targets against methotrexate resistance of colon cancer

Multi-omics “Upstream Analysis” of regulatory genomic regions helps identifying targets against methotrexate resistance of colon cancer

Beitrag, Englisch, ELSEVIER Ltd.

Autoren: Dr. Alexander Kel, Philip Stegmaier, Jeannette Koschman und 2 weitere

Herausgeber / Co-Autor: Alexander E. Kel, Philip Stegmaier, Tagir Valeev, Jeannette Koschmann, Vladimir Poroikov, Olga V. Kel-Margoulis, Edgar Wingender

Erscheinungsdatum: 15.02.2017

Quelle: EuPA Open Proteomics 12, 1-13


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Highlights

  • Upstream analysis strategy for multi-omics data is proposed.
  • Drug targets are predicted by search for TFBS and analysis of signaling network.
  • Methotrexate resistance data include transcriptomics, proteomics and epigenomics.
  • Predicted targets are: TGFalpha, IGFBP7, alpha9-integrin.
  • Predicted drugs are: zardaverine, divalproex and human metabolite nicotinamide N-oxide.

Dr. Alexander Kel

DE, Wolfenbüttel

Geschäftsführer (CSO)

geneXplain GmbH

Publikationen: 12

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Philip Stegmaier

DE, Wolfenbüttel

Project Manager

geneXplain GmbH

Publikationen: 5

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Dr. Olga Kel-Margoulis

DE, Wolfenbüttel

Director Applied Life Science Informatics

geneXplain GmbH

Publikationen: 1

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Prof. Dr. Edgar Wingender

DE, Wolfenbüttel, Niedersachsen

Geschäftsführer (CEO)

geneXplain GmbH

Publikationen: 12

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